Если я могу называть эти файлы как угодно, как мне их назвать?

Это зависит от вас! Вот несколько вариантов:

• Используйте существующую терминологию: schema.yml (хотя это может затруднить поиск нужного файла со временем)
• Используйте то же имя, что и у вашего каталога (при условии, что вы используете разумные имена для ваших каталогов)
• Если вы тестируете и документируете одну модель (или seed, snapshot, macro и т.д.) на файл, вы можете дать ему то же имя, что и у модели (или seed, snapshot, macro и т.д.)

Выберите то, что подходит вашей команде. У нас есть больше рекомендаций в нашем руководстве по структурированию проектов dbt.